MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	GATG	2	8	48	55	25 %	25 %	50 %	0 %	109644368
2	NC_008213	TGA	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
3	NC_008213	CTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644368
4	NC_008213	GATG	2	8	202	209	25 %	25 %	50 %	0 %	109644368
5	NC_008213	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644368
6	NC_008213	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
7	NC_008213	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
8	NC_008213	TCGGTG	2	12	365	376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	109644368
9	NC_008213	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
10	NC_008213	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644368
11	NC_008213	AGC	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
12	NC_008213	TGA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
13	NC_008213	TCG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
14	NC_008213	CAC	2	6	854	859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644369
15	NC_008213	ATC	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
16	NC_008213	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644369
17	NC_008213	TCA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
18	NC_008213	TCC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
19	NC_008213	TG	3	6	1002	1007	0 %	50 %	50 %	0 %	109644369
20	NC_008213	GTTC	2	8	1147	1154	0 %	50 %	25 %	25 %	109644369
21	NC_008213	CTCG	2	8	1184	1191	0 %	25 %	25 %	50 %	109644369
22	NC_008213	TCC	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
23	NC_008213	GAC	3	9	1206	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644369
24	NC_008213	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
25	NC_008213	ATG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644369
26	NC_008213	TCTT	2	8	1797	1804	0 %	75 %	0 %	25 %	109644370
27	NC_008213	CATT	2	8	1852	1859	25 %	50 %	0 %	25 %	109644370
28	NC_008213	TCCC	2	8	1860	1867	0 %	25 %	0 %	75 %	109644370
29	NC_008213	GTTGT	2	10	1952	1961	0 %	60 %	40 %	0 %	109644370
30	NC_008213	CTG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644370
31	NC_008213	GTCACT	2	12	2093	2104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109644370
32	NC_008213	ACT	3	9	2102	2110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
33	NC_008213	GAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
34	NC_008213	TGTC	2	8	2134	2141	0 %	50 %	25 %	25 %	109644370
35	NC_008213	GAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644370
36	NC_008213	AGCCT	2	10	2190	2199	20 %	20 %	20 %	40 %	109644370
37	NC_008213	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
38	NC_008213	TCA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
39	NC_008213	ATCTC	2	10	2367	2376	20 %	40 %	0 %	40 %	109644370
40	NC_008213	AT	3	6	2382	2387	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
41	NC_008213	TGCAT	2	10	2422	2431	20 %	40 %	20 %	20 %	109644370
42	NC_008213	TG	3	6	2435	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	109644370
43	NC_008213	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
44	NC_008213	TCAG	2	8	3974	3981	25 %	25 %	25 %	25 %	109644371
45	NC_008213	TAT	2	6	4001	4006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644371
46	NC_008213	T	8	8	4020	4027	0 %	100 %	0 %	0 %	109644371
47	NC_008213	TTG	2	6	4078	4083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644371
48	NC_008213	TAA	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
49	NC_008213	CT	3	6	4151	4156	0 %	50 %	0 %	50 %	109644371
50	NC_008213	TGGT	2	8	4173	4180	0 %	50 %	50 %	0 %	109644371
51	NC_008213	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
52	NC_008213	TA	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	109644371
53	NC_008213	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
54	NC_008213	ACT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
55	NC_008213	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
56	NC_008213	TGC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644371
57	NC_008213	TAT	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
58	NC_008213	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
59	NC_008213	ATC	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644372
60	NC_008213	TGA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644372
61	NC_008213	ATT	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
62	NC_008213	GCT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644372
63	NC_008213	CGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
64	NC_008213	GAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
65	NC_008213	TGA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
66	NC_008213	TCTG	2	8	5571	5578	0 %	50 %	25 %	25 %	109644373
67	NC_008213	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
68	NC_008213	GAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
69	NC_008213	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
70	NC_008213	GAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
71	NC_008213	ACC	3	9	5813	5821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
72	NC_008213	GCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
73	NC_008213	TCC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644373
74	NC_008213	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
75	NC_008213	CTG	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
76	NC_008213	ATCA	2	8	6177	6184	50 %	25 %	0 %	25 %	109644373
77	NC_008213	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644373
78	NC_008213	GAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
79	NC_008213	CAGT	2	8	6320	6327	25 %	25 %	25 %	25 %	109644373
80	NC_008213	GTC	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
81	NC_008213	ATT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644373
82	NC_008213	GA	4	8	6422	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
83	NC_008213	TCT	2	6	6520	6525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
84	NC_008213	GA	4	8	6562	6569	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
85	NC_008213	GTG	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644373
86	NC_008213	CGT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
87	NC_008213	GGA	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644373
88	NC_008213	TCT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
89	NC_008213	ATTG	2	8	6720	6727	25 %	50 %	25 %	0 %	109644373
90	NC_008213	CTGCTC	2	12	6791	6802	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109644373
91	NC_008213	GAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
92	NC_008213	AT	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	109644374
93	NC_008213	GTT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644374
94	NC_008213	GAG	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
95	NC_008213	AG	3	6	7359	7364	50 %	0 %	50 %	0 %	109644374
96	NC_008213	ACAG	2	8	7376	7383	50 %	0 %	25 %	25 %	109644374
97	NC_008213	TC	3	6	7486	7491	0 %	50 %	0 %	50 %	109644374
98	NC_008213	CAC	2	6	7500	7505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644374
99	NC_008213	CATGAC	2	12	7520	7531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	109644374
100	NC_008213	ATC	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644375
101	NC_008213	CGA	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644375
102	NC_008213	TAA	2	6	7909	7914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644375
103	NC_008213	GATAT	2	10	8390	8399	40 %	40 %	20 %	0 %	109644376
104	NC_008213	GTAC	2	8	8508	8515	25 %	25 %	25 %	25 %	109644376
105	NC_008213	AT	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	109644376
106	NC_008213	ACAG	2	8	8586	8593	50 %	0 %	25 %	25 %	109644376
107	NC_008213	GAT	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
108	NC_008213	CTG	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644376
109	NC_008213	CTC	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644376
110	NC_008213	GAT	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
111	NC_008213	TGA	2	6	8790	8795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
112	NC_008213	GAAC	2	8	9171	9178	50 %	0 %	25 %	25 %	109644377
113	NC_008213	GGA	2	6	9259	9264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644377
114	NC_008213	CGA	2	6	9272	9277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
115	NC_008213	GAT	2	6	9291	9296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644377
116	NC_008213	GAC	3	9	9382	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
117	NC_008213	CTGTGG	2	12	9453	9464	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	109644377
118	NC_008213	CAGA	2	8	9476	9483	50 %	0 %	25 %	25 %	109644377
119	NC_008213	ATC	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
120	NC_008213	CGGA	2	8	9504	9511	25 %	0 %	50 %	25 %	109644377
121	NC_008213	CAT	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
122	NC_008213	AT	3	6	9540	9545	50 %	50 %	0 %	0 %	109644377
123	NC_008213	TGTA	2	8	10709	10716	25 %	50 %	25 %	0 %	109644378
124	NC_008213	TGAG	2	8	10717	10724	25 %	25 %	50 %	0 %	109644378
125	NC_008213	TCA	2	6	10751	10756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644378
126	NC_008213	GAA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
127	NC_008213	GAGGAT	2	12	10767	10778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	109644378
128	NC_008213	GAA	3	9	10812	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
129	NC_008213	GAA	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
130	NC_008213	GAT	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644378
131	NC_008213	ACC	2	6	10890	10895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644378
132	NC_008213	AGC	2	6	10958	10963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644378
133	NC_008213	TGC	2	6	11005	11010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644378
134	NC_008213	GTC	2	6	11041	11046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644378
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139	NC_008213	GAC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
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149	NC_008213	CTG	2	6	12170	12175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644379
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262	NC_008213	TC	3	6	17804	17809	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
263	NC_008213	TCC	2	6	17900	17905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644380
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265	NC_008213	AGT	2	6	18096	18101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644380
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